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Bajo anestesia, se abrió el abdomen, se ligó el ciego por encima de las válvulas ileocecales y se realizaron dos perforaciones con un catéter IV 14G. Se reanimó a las ratas con solución salina normal, se les inyectaron analgésicos y se les devolvió a las jaulas con comida y agua ab libitum.
Se purificó el ARN de tres pulmones congelados de cada uno de los cuatro grupos utilizando el kit RNEasy (Qiagen) seguido de la columna RNeasy. La calidad del ARN se evaluó en Tapestation con el kit RNA ScreenTape (Agilent Technologies) y se cuantificó con el aparato Qubit (kit Qubit® DNA HS Assay, Invitrogen). Las bibliotecas se prepararon con el kit SENSE mRNA-Seq Library Prep. El ADN agrupado se cargó en el cartucho (illumine) del kit NextSeq 500 High Output v2 (75 ciclos) y se secuenció en el sistema Illumina NextSeq 500, utilizando condiciones de secuenciación de 75 ciclos, lectura única.
Las lecturas en bruto se recortaron de sus primeras 9 bases, utilizando el paquete FASTX (versión 0.0.14)Las bases de baja calidad se recortaron de ambos extremos con un umbral de 32, utilizando scripts propios.Las secuencias adaptadoras se eliminaron con cutadapt (versión 1.12)Las lecturas de baja calidad se filtraron con el paquete FASTX, utilizando un umbral de 20 sobre el 90 por ciento de las posiciones de la lectura. Las lecturas procesadas se alinearon con TopHat (v2.0.14), con un máximo de 3 desajustes, utilizando un archivo GTF ampliado con 3’UTRs más largas, basado en la versión 84 de Ensembl. Las lecturas por gen se contaron con htseq-count (versión 0.6.0). Los valores de expresión normalizados y las pruebas de expresión diferencial se realizaron con DESeq2 (versión 1.12.4): Rnor6Ficheros_complementarios_formato_y_contenido: Una hoja Excel con columnas para detalles generales de los genes, recuentos brutos en cada muestra, recuentos normalizados, expresión media, grupos de 5 columnas de resultados de DESeq2 para cada comparación, columnas de significación según determinados umbrales (como se indica). Todas las columnas tienen encabezados informativos.
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La luz es esencial para la visión, pero desde las primeras semanas de vida (1-5) también provoca importantes efectos no relacionados con la formación de imágenes (NIF) que son potentes determinantes del sueño (6), los ritmos circadianos (7), el estado de alerta (8, 9), el estado de ánimo (10) y la secreción hormonal (11). Este documento está dirigido a profesionales de la iluminación, responsables políticos e investigadores con un interés práctico en los efectos NIF de la luz mediados por el ojo, la cronobiología y la salud. En él se explica y analiza una metrología estandarizada de la luz (12) que se basa en cinco tipos de fotorreceptores retinianos, cada uno de los cuales tiene una sensibilidad espectral distinta y puede contribuir a respuestas no visuales o NIF (13). Cabe destacar que la melanopsina es el fotopigmento funcional de uno de estos cinco tipos de fotorreceptores.
Las pruebas acumuladas (6, 14-21) sugieren que la sensibilidad espectral de la melanopsina es el modelo más exitoso y parsimonioso para predecir las respuestas a exposiciones de media y larga duración a la luz ambiental, como el cambio de fase circadiano o las modulaciones en el tamaño de la pupila, el estado de alerta y la secreción de melatonina. Sin embargo, ningún espectro de acción o proxy proporcionará nunca una imagen completa (13, 22) de todas las variaciones comprobables en intensidad, tiempo, duración y patrones de exposición a la luz que pueden crearse en entornos de laboratorio (23, 24). Además, los efectos de la luz en entornos de campo se ven a menudo confundidos por diversas incertidumbres que pueden deberse a efectos no fóticos, variaciones interindividuales en la sensibilidad a la luz (25), diferencias en las poblaciones estudiadas y el menor control ambiental y conductual en entornos reales. Aun reconociendo estas limitaciones, se presentarán algunos ejemplos para sugerir formas en las que las cantidades basadas en la melanopsina de la metrología estandarizada de la luz (12) pueden aplicarse ya en la práctica.
Sensores
Este tutorial explica los fundamentos del formato numérico de Excel y proporciona una guía detallada para crear formatos personalizados. Aprenderás cómo mostrar el número requerido de decimales, cambiar la alineación o el color de la fuente, mostrar un símbolo de moneda, redondear números por miles, mostrar ceros a la izquierda y mucho más.
Microsoft Excel tiene muchos formatos incorporados para números, divisas, porcentajes, contabilidad, fechas y horas. Pero hay situaciones en las que necesitas algo muy específico. Si ninguno de los formatos incorporados en Excel satisface sus necesidades, puede crear su propio formato numérico.
El formato numérico en Excel es una herramienta muy poderosa, y una vez que aprendes a usarla en propiedad, tus opciones son casi ilimitadas. El objetivo de este tutorial es explicar los aspectos más esenciales del formato numérico de Excel y ponerte en el buen camino para dominar el formato numérico personalizado.
Espera, espera, pero ¿qué significan todos esos símbolos en el cuadro Tipo? ¿Y cómo los pongo en la combinación correcta para mostrar los números como quiero? Bueno, de eso se trata el resto de este tutorial 🙂